Основные методы, которые будем использовать в данном примере описаны тут: Класс для работы с комментариями. Рассмотрим работу с комментариями:

• получить все комментарии (GetAllComments). Получаем массив со всеми комментариями. Также, в примере ниже приведён пример работы с массивом комментариев с использованием метода GetText;
• удалим комментарий с индексом 1 (Delete);

builder.OpenFile("comments.docx");
var oDocument = Api.GetDocument();
var oParagraph = oDocument.GetElement(0);
var aComments = oDocument.GetAllComments(); //получаем массив со всеми комментариями
var sType = aComments[0].GetClassType();
oParagraph = Api.CreateParagraph(); //создаём параграф куда добавим элементы массива т.е. комментарии
oParagraph.AddText("Comment 0: " + aComments[0].GetText()); //выводим комментарий
oDocument.Push(oParagraph);
oParagraph = Api.CreateParagraph();
oParagraph.AddText("Comment 1: " + aComments[1].GetText());
oDocument.Push(oParagraph);

oParagraph = Api.CreateParagraph(); //создадим параграф куда выведем весь массив комментариев
oParagraph.AddText("Ниже выведем в цикле комменты из массива ");
oDocument.Push(oParagraph);
for (let i = 0; i < aComments.length; i++) { // в цикле выводим все комментарии
oParagraph = Api.CreateParagraph();
oParagraph.AddText("Коммент: " + aComments[i].GetText());
oDocument.Push(oParagraph);
}

oParagraph = Api.CreateParagraph();
oParagraph.AddText("Удалим коммент под индексом 1 ");
oDocument.Push(oParagraph);

aComments[1].Delete(); //удаляем комментарий с индексом 1
oParagraph = Api.CreateParagraph();
var aComments = oDocument.GetAllComments(); //перечитаем комменты в документе после удаления
oParagraph.AddText("Ниже выведем в цикле комменты из массива, после удаления ");
oDocument.Push(oParagraph);
for (let i = 0; i < aComments.length; i++) {
oParagraph = Api.CreateParagraph();
oParagraph.AddText("Комментарий: " + aComments[i].GetText());
oDocument.Push(oParagraph);
}

builder.SaveFile("docx", "GetAllCommentsAndDelete.docx");
builder.CloseFile();

Также, Вам может пригодиться Справочник методов класса ApiCommentReply текстового документа для работы с ответами на комментариями.